Amate Yuzuriha est une lycéenne qui vit paisiblement dans une colonie spatiale flottant dans l’espace. Lorsqu’elle rencontre un réfugié de guerre nommé Nyaan, Amate est entraînée dans un sport illégal de duel de Mobile Suit connu sous le nom de Clan Battle. Sous le pseudonyme de « Machu », elle se lance dans une bataille acharnée jour après jour, aux commandes du GQuuuuuuuX. Puis, un Mobile Suit Gundam non identifié apparaît devant elle, poursuivi à la fois par la force spatiale et la police, ainsi que par son pilote, un garçon nommé Shuji. Leur monde entre désormais dans une nouvelle ère.